İnek ve keçi sütlerinin protein içeriği %3-3,5 arasında olmasına rağmen kazein fraksiyonları farklıdır.
Keçi döngüsünde daha düşük miktarlarda αs1-kazein bulunur; Düşük αs1-kazein, keçi sütünün daha yumuşak bir pıhtı oluşturmasına neden olur. Bu sindirimi kolaylaştırır. Keçi hattında, inek sistemine göre yağ kürecikleri daha yaygın olarak dağılır ve çok sayıda oldukları için sindirimi kolaydır. Keçi soyunda kısa ve orta zincirli tekli ve çoklu doymamış yağ asitleri yüksektir ve 6-10 karbonlu olanların oranı inek döngüsündekinin en az iki katıdır.
